Protein–RNA interactions for Protein: L7N2C0

Gm6401, Predicted gene 6401 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6401L7N2C0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6401L7N2C0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6401L7N2C0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6401L7N2C0 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6401L7N2C0 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6401L7N2C0 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6401L7N2C0 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6401L7N2C0 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6401L7N2C0 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6401L7N2C0 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6401L7N2C0 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6401L7N2C0 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6401L7N2C0 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6401L7N2C0 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6401L7N2C0 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6401L7N2C0 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6401L7N2C0 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6401L7N2C0 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6401L7N2C0 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6401L7N2C0 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6401L7N2C0 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6401L7N2C0 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6401L7N2C0 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6401L7N2C0 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6401L7N2C0 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6401L7N2C0 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6401L7N2C0 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6401L7N2C0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6401L7N2C0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6401L7N2C0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6401L7N2C0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6401L7N2C0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6401L7N2C0 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6401L7N2C0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6401L7N2C0 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6401L7N2C0 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6401L7N2C0 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6401L7N2C0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6401L7N2C0 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6401L7N2C0 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6401L7N2C0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6401L7N2C0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6401L7N2C0 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6401L7N2C0 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6401L7N2C0 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6401L7N2C0 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6401L7N2C0 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6401L7N2C0 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6401L7N2C0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6401L7N2C0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6401L7N2C0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6401L7N2C0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6401L7N2C0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6401L7N2C0 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6401L7N2C0 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6401L7N2C0 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6401L7N2C0 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6401L7N2C0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6401L7N2C0 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6401L7N2C0 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6401L7N2C0 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6401L7N2C0 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6401L7N2C0 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6401L7N2C0 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6401L7N2C0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6401L7N2C0 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6401L7N2C0 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6401L7N2C0 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6401L7N2C0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6401L7N2C0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6401L7N2C0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6401L7N2C0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6401L7N2C0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6401L7N2C0 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6401L7N2C0 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6401L7N2C0 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6401L7N2C0 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6401L7N2C0 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6401L7N2C0 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6401L7N2C0 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6401L7N2C0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6401L7N2C0 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6401L7N2C0 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6401L7N2C0 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6401L7N2C0 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6401L7N2C0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6401L7N2C0 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6401L7N2C0 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6401L7N2C0 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6401L7N2C0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6401L7N2C0 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6401L7N2C0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6401L7N2C0 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6401L7N2C0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6401L7N2C0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6401L7N2C0 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6401L7N2C0 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6401L7N2C0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6401L7N2C0 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6401L7N2C0 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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