Protein–RNA interactions for Protein: J9JI28

Vwa3b, von Willebrand factor A domain-containing 3B, mousemouse

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Length 736 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa3bJ9JI28 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vwa3bJ9JI28 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vwa3bJ9JI28 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vwa3bJ9JI28 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vwa3bJ9JI28 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vwa3bJ9JI28 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vwa3bJ9JI28 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vwa3bJ9JI28 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vwa3bJ9JI28 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vwa3bJ9JI28 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vwa3bJ9JI28 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vwa3bJ9JI28 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vwa3bJ9JI28 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vwa3bJ9JI28 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vwa3bJ9JI28 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vwa3bJ9JI28 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vwa3bJ9JI28 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vwa3bJ9JI28 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vwa3bJ9JI28 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vwa3bJ9JI28 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vwa3bJ9JI28 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vwa3bJ9JI28 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Vwa3bJ9JI28 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vwa3bJ9JI28 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vwa3bJ9JI28 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vwa3bJ9JI28 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vwa3bJ9JI28 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vwa3bJ9JI28 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vwa3bJ9JI28 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vwa3bJ9JI28 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vwa3bJ9JI28 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vwa3bJ9JI28 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vwa3bJ9JI28 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vwa3bJ9JI28 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vwa3bJ9JI28 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vwa3bJ9JI28 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vwa3bJ9JI28 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vwa3bJ9JI28 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vwa3bJ9JI28 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vwa3bJ9JI28 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Vwa3bJ9JI28 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vwa3bJ9JI28 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vwa3bJ9JI28 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vwa3bJ9JI28 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vwa3bJ9JI28 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Vwa3bJ9JI28 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vwa3bJ9JI28 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vwa3bJ9JI28 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vwa3bJ9JI28 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vwa3bJ9JI28 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vwa3bJ9JI28 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Vwa3bJ9JI28 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vwa3bJ9JI28 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Vwa3bJ9JI28 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Vwa3bJ9JI28 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vwa3bJ9JI28 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vwa3bJ9JI28 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vwa3bJ9JI28 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vwa3bJ9JI28 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vwa3bJ9JI28 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vwa3bJ9JI28 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vwa3bJ9JI28 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vwa3bJ9JI28 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vwa3bJ9JI28 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vwa3bJ9JI28 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vwa3bJ9JI28 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vwa3bJ9JI28 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vwa3bJ9JI28 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vwa3bJ9JI28 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vwa3bJ9JI28 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vwa3bJ9JI28 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vwa3bJ9JI28 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vwa3bJ9JI28 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vwa3bJ9JI28 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Vwa3bJ9JI28 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vwa3bJ9JI28 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vwa3bJ9JI28 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vwa3bJ9JI28 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vwa3bJ9JI28 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vwa3bJ9JI28 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vwa3bJ9JI28 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vwa3bJ9JI28 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vwa3bJ9JI28 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vwa3bJ9JI28 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vwa3bJ9JI28 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vwa3bJ9JI28 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vwa3bJ9JI28 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vwa3bJ9JI28 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vwa3bJ9JI28 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vwa3bJ9JI28 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vwa3bJ9JI28 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vwa3bJ9JI28 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vwa3bJ9JI28 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vwa3bJ9JI28 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vwa3bJ9JI28 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vwa3bJ9JI28 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vwa3bJ9JI28 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vwa3bJ9JI28 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vwa3bJ9JI28 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vwa3bJ9JI28 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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