Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm2056J3QQ02 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms