Protein–RNA interactions for Protein: J3QPX5

Gm8888, Predicted gene 8888, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8888J3QPX5 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm8888J3QPX5 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms