Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Gm2035J3QP87 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Gm2035J3QP87 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Gm2035J3QP87 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Gm2035J3QP87 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Gm2035J3QP87 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Gm2035J3QP87 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm2035J3QP87 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
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Gm2035J3QP87 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2035J3QP87 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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