Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim18J3QNP2 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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