Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ9

Gm20873, Predicted gene, 20873, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20873J3QMQ9 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20873J3QMQ9 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20873J3QMQ9 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20873J3QMQ9 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20873J3QMQ9 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20873J3QMQ9 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20873J3QMQ9 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20873J3QMQ9 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20873J3QMQ9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20873J3QMQ9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20873J3QMQ9 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20873J3QMQ9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20873J3QMQ9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20873J3QMQ9 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20873J3QMQ9 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20873J3QMQ9 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20873J3QMQ9 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20873J3QMQ9 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20873J3QMQ9 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20873J3QMQ9 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20873J3QMQ9 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gm20873J3QMQ9 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gm20873J3QMQ9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gm20873J3QMQ9 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gm20873J3QMQ9 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20873J3QMQ9 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20873J3QMQ9 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20873J3QMQ9 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20873J3QMQ9 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20873J3QMQ9 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20873J3QMQ9 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20873J3QMQ9 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20873J3QMQ9 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20873J3QMQ9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20873J3QMQ9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20873J3QMQ9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20873J3QMQ9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20873J3QMQ9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20873J3QMQ9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20873J3QMQ9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20873J3QMQ9 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20873J3QMQ9 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20873J3QMQ9 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20873J3QMQ9 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20873J3QMQ9 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20873J3QMQ9 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20873J3QMQ9 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20873J3QMQ9 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20873J3QMQ9 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20873J3QMQ9 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20873J3QMQ9 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20873J3QMQ9 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20873J3QMQ9 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20873J3QMQ9 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20873J3QMQ9 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20873J3QMQ9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20873J3QMQ9 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20873J3QMQ9 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20873J3QMQ9 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20873J3QMQ9 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20873J3QMQ9 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20873J3QMQ9 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20873J3QMQ9 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20873J3QMQ9 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20873J3QMQ9 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20873J3QMQ9 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20873J3QMQ9 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20873J3QMQ9 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20873J3QMQ9 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20873J3QMQ9 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20873J3QMQ9 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20873J3QMQ9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20873J3QMQ9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20873J3QMQ9 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20873J3QMQ9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20873J3QMQ9 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20873J3QMQ9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20873J3QMQ9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20873J3QMQ9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20873J3QMQ9 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20873J3QMQ9 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20873J3QMQ9 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20873J3QMQ9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20873J3QMQ9 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20873J3QMQ9 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20873J3QMQ9 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20873J3QMQ9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20873J3QMQ9 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20873J3QMQ9 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20873J3QMQ9 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20873J3QMQ9 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20873J3QMQ9 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20873J3QMQ9 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20873J3QMQ9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20873J3QMQ9 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20873J3QMQ9 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20873J3QMQ9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20873J3QMQ9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20873J3QMQ9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20873J3QMQ9 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms