Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS0

Gm21411, Predicted gene, 21411, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21411J3KMS0 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21411J3KMS0 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21411J3KMS0 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms