Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Taf4bG5E8Z2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Taf4bG5E8Z2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Taf4bG5E8Z2 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Taf4bG5E8Z2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Taf4bG5E8Z2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Taf4bG5E8Z2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Taf4bG5E8Z2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Taf4bG5E8Z2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Taf4bG5E8Z2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Taf4bG5E8Z2 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Taf4bG5E8Z2 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Taf4bG5E8Z2 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Taf4bG5E8Z2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Taf4bG5E8Z2 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Taf4bG5E8Z2 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Taf4bG5E8Z2 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Taf4bG5E8Z2 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Taf4bG5E8Z2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf4bG5E8Z2 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf4bG5E8Z2 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf4bG5E8Z2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf4bG5E8Z2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf4bG5E8Z2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf4bG5E8Z2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf4bG5E8Z2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf4bG5E8Z2 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf4bG5E8Z2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf4bG5E8Z2 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf4bG5E8Z2 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf4bG5E8Z2 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf4bG5E8Z2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf4bG5E8Z2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf4bG5E8Z2 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf4bG5E8Z2 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf4bG5E8Z2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Taf4bG5E8Z2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Taf4bG5E8Z2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Taf4bG5E8Z2 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Taf4bG5E8Z2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Taf4bG5E8Z2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Taf4bG5E8Z2 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Taf4bG5E8Z2 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Taf4bG5E8Z2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Taf4bG5E8Z2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Taf4bG5E8Z2 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Taf4bG5E8Z2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Taf4bG5E8Z2 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Taf4bG5E8Z2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Taf4bG5E8Z2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Taf4bG5E8Z2 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Taf4bG5E8Z2 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Taf4bG5E8Z2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf4bG5E8Z2 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf4bG5E8Z2 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf4bG5E8Z2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf4bG5E8Z2 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf4bG5E8Z2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf4bG5E8Z2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf4bG5E8Z2 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf4bG5E8Z2 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf4bG5E8Z2 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf4bG5E8Z2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf4bG5E8Z2 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf4bG5E8Z2 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf4bG5E8Z2 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf4bG5E8Z2 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf4bG5E8Z2 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf4bG5E8Z2 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf4bG5E8Z2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf4bG5E8Z2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf4bG5E8Z2 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf4bG5E8Z2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf4bG5E8Z2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Taf4bG5E8Z2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Taf4bG5E8Z2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Taf4bG5E8Z2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Taf4bG5E8Z2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Taf4bG5E8Z2 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Taf4bG5E8Z2 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Taf4bG5E8Z2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Taf4bG5E8Z2 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Taf4bG5E8Z2 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Taf4bG5E8Z2 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Taf4bG5E8Z2 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Taf4bG5E8Z2 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Taf4bG5E8Z2 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Taf4bG5E8Z2 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Taf4bG5E8Z2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Taf4bG5E8Z2 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Taf4bG5E8Z2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Taf4bG5E8Z2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Taf4bG5E8Z2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Taf4bG5E8Z2 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Taf4bG5E8Z2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Taf4bG5E8Z2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Taf4bG5E8Z2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Taf4bG5E8Z2 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Taf4bG5E8Z2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Taf4bG5E8Z2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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