Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X2

Pabpc4l, MCG12357, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4lG5E8X2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pabpc4lG5E8X2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pabpc4lG5E8X2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms