Protein–RNA interactions for Protein: G5E8K1

2610028H24Rik, RIKEN cDNA 2610028H24, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610028H24RikG5E8K1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
2610028H24RikG5E8K1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
2610028H24RikG5E8K1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
2610028H24RikG5E8K1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
2610028H24RikG5E8K1 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
2610028H24RikG5E8K1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
2610028H24RikG5E8K1 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
2610028H24RikG5E8K1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
2610028H24RikG5E8K1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
2610028H24RikG5E8K1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
2610028H24RikG5E8K1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
2610028H24RikG5E8K1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
2610028H24RikG5E8K1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
2610028H24RikG5E8K1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
2610028H24RikG5E8K1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
2610028H24RikG5E8K1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
2610028H24RikG5E8K1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
2610028H24RikG5E8K1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
2610028H24RikG5E8K1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
2610028H24RikG5E8K1 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
2610028H24RikG5E8K1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
2610028H24RikG5E8K1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
2610028H24RikG5E8K1 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
2610028H24RikG5E8K1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
2610028H24RikG5E8K1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
2610028H24RikG5E8K1 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
2610028H24RikG5E8K1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
2610028H24RikG5E8K1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
2610028H24RikG5E8K1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
2610028H24RikG5E8K1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
2610028H24RikG5E8K1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
2610028H24RikG5E8K1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
2610028H24RikG5E8K1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
2610028H24RikG5E8K1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
2610028H24RikG5E8K1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
2610028H24RikG5E8K1 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
2610028H24RikG5E8K1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
2610028H24RikG5E8K1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
2610028H24RikG5E8K1 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
2610028H24RikG5E8K1 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
2610028H24RikG5E8K1 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
2610028H24RikG5E8K1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
2610028H24RikG5E8K1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
2610028H24RikG5E8K1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
2610028H24RikG5E8K1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
2610028H24RikG5E8K1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
2610028H24RikG5E8K1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
2610028H24RikG5E8K1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
2610028H24RikG5E8K1 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
2610028H24RikG5E8K1 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
2610028H24RikG5E8K1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
2610028H24RikG5E8K1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
2610028H24RikG5E8K1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
2610028H24RikG5E8K1 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
2610028H24RikG5E8K1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
2610028H24RikG5E8K1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
2610028H24RikG5E8K1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
2610028H24RikG5E8K1 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
2610028H24RikG5E8K1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
2610028H24RikG5E8K1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
2610028H24RikG5E8K1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
2610028H24RikG5E8K1 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
2610028H24RikG5E8K1 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
2610028H24RikG5E8K1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
2610028H24RikG5E8K1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
2610028H24RikG5E8K1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
2610028H24RikG5E8K1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
2610028H24RikG5E8K1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
2610028H24RikG5E8K1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
2610028H24RikG5E8K1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
2610028H24RikG5E8K1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
2610028H24RikG5E8K1 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
2610028H24RikG5E8K1 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
2610028H24RikG5E8K1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
2610028H24RikG5E8K1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
2610028H24RikG5E8K1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
2610028H24RikG5E8K1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
2610028H24RikG5E8K1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
2610028H24RikG5E8K1 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
2610028H24RikG5E8K1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
2610028H24RikG5E8K1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
2610028H24RikG5E8K1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
2610028H24RikG5E8K1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
2610028H24RikG5E8K1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
2610028H24RikG5E8K1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
2610028H24RikG5E8K1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
2610028H24RikG5E8K1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
2610028H24RikG5E8K1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
2610028H24RikG5E8K1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
2610028H24RikG5E8K1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
2610028H24RikG5E8K1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
2610028H24RikG5E8K1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
2610028H24RikG5E8K1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
2610028H24RikG5E8K1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
2610028H24RikG5E8K1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
2610028H24RikG5E8K1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
2610028H24RikG5E8K1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
2610028H24RikG5E8K1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
2610028H24RikG5E8K1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
2610028H24RikG5E8K1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms