Protein–RNA interactions for Protein: G5E870

Trip12, E3 ubiquitin-protein ligase TRIP12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip12G5E870 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trip12G5E870 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trip12G5E870 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trip12G5E870 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trip12G5E870 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trip12G5E870 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip12G5E870 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip12G5E870 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip12G5E870 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip12G5E870 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip12G5E870 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip12G5E870 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip12G5E870 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip12G5E870 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip12G5E870 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip12G5E870 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip12G5E870 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip12G5E870 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip12G5E870 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip12G5E870 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip12G5E870 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip12G5E870 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip12G5E870 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip12G5E870 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip12G5E870 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip12G5E870 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip12G5E870 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip12G5E870 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip12G5E870 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip12G5E870 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip12G5E870 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip12G5E870 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip12G5E870 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip12G5E870 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip12G5E870 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip12G5E870 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip12G5E870 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip12G5E870 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip12G5E870 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip12G5E870 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip12G5E870 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip12G5E870 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip12G5E870 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip12G5E870 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip12G5E870 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip12G5E870 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip12G5E870 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip12G5E870 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip12G5E870 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip12G5E870 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip12G5E870 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip12G5E870 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip12G5E870 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip12G5E870 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip12G5E870 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trip12G5E870 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trip12G5E870 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trip12G5E870 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trip12G5E870 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trip12G5E870 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trip12G5E870 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trip12G5E870 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trip12G5E870 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trip12G5E870 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trip12G5E870 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trip12G5E870 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trip12G5E870 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trip12G5E870 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trip12G5E870 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trip12G5E870 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trip12G5E870 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trip12G5E870 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trip12G5E870 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trip12G5E870 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trip12G5E870 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trip12G5E870 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trip12G5E870 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trip12G5E870 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trip12G5E870 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trip12G5E870 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trip12G5E870 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trip12G5E870 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trip12G5E870 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms