Protein–RNA interactions for Protein: G3XA12

4933406M09Rik, RIKEN cDNA 4933406M09, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933406M09RikG3XA12 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
4933406M09RikG3XA12 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
4933406M09RikG3XA12 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4933406M09RikG3XA12 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
4933406M09RikG3XA12 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4933406M09RikG3XA12 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
4933406M09RikG3XA12 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4933406M09RikG3XA12 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4933406M09RikG3XA12 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
4933406M09RikG3XA12 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
4933406M09RikG3XA12 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4933406M09RikG3XA12 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
4933406M09RikG3XA12 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4933406M09RikG3XA12 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
4933406M09RikG3XA12 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4933406M09RikG3XA12 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
4933406M09RikG3XA12 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
4933406M09RikG3XA12 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4933406M09RikG3XA12 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
4933406M09RikG3XA12 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4933406M09RikG3XA12 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4933406M09RikG3XA12 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4933406M09RikG3XA12 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
4933406M09RikG3XA12 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
4933406M09RikG3XA12 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
4933406M09RikG3XA12 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4933406M09RikG3XA12 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4933406M09RikG3XA12 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4933406M09RikG3XA12 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4933406M09RikG3XA12 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4933406M09RikG3XA12 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4933406M09RikG3XA12 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4933406M09RikG3XA12 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4933406M09RikG3XA12 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4933406M09RikG3XA12 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4933406M09RikG3XA12 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4933406M09RikG3XA12 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4933406M09RikG3XA12 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4933406M09RikG3XA12 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4933406M09RikG3XA12 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4933406M09RikG3XA12 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4933406M09RikG3XA12 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4933406M09RikG3XA12 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4933406M09RikG3XA12 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4933406M09RikG3XA12 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4933406M09RikG3XA12 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4933406M09RikG3XA12 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4933406M09RikG3XA12 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4933406M09RikG3XA12 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4933406M09RikG3XA12 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4933406M09RikG3XA12 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4933406M09RikG3XA12 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4933406M09RikG3XA12 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4933406M09RikG3XA12 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4933406M09RikG3XA12 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
4933406M09RikG3XA12 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms