Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pcf11G3X9Z4 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pcf11G3X9Z4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pcf11G3X9Z4 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pcf11G3X9Z4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pcf11G3X9Z4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pcf11G3X9Z4 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Pcf11G3X9Z4 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pcf11G3X9Z4 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Pcf11G3X9Z4 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pcf11G3X9Z4 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pcf11G3X9Z4 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pcf11G3X9Z4 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pcf11G3X9Z4 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pcf11G3X9Z4 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Pcf11G3X9Z4 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pcf11G3X9Z4 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pcf11G3X9Z4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pcf11G3X9Z4 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pcf11G3X9Z4 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pcf11G3X9Z4 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pcf11G3X9Z4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pcf11G3X9Z4 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pcf11G3X9Z4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pcf11G3X9Z4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pcf11G3X9Z4 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Pcf11G3X9Z4 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pcf11G3X9Z4 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pcf11G3X9Z4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pcf11G3X9Z4 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pcf11G3X9Z4 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Pcf11G3X9Z4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pcf11G3X9Z4 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pcf11G3X9Z4 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pcf11G3X9Z4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pcf11G3X9Z4 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pcf11G3X9Z4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pcf11G3X9Z4 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pcf11G3X9Z4 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pcf11G3X9Z4 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Pcf11G3X9Z4 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pcf11G3X9Z4 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pcf11G3X9Z4 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pcf11G3X9Z4 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pcf11G3X9Z4 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pcf11G3X9Z4 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pcf11G3X9Z4 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pcf11G3X9Z4 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pcf11G3X9Z4 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pcf11G3X9Z4 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pcf11G3X9Z4 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pcf11G3X9Z4 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pcf11G3X9Z4 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pcf11G3X9Z4 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pcf11G3X9Z4 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Pcf11G3X9Z4 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pcf11G3X9Z4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pcf11G3X9Z4 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pcf11G3X9Z4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Pcf11G3X9Z4 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Pcf11G3X9Z4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Pcf11G3X9Z4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Pcf11G3X9Z4 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Pcf11G3X9Z4 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pcf11G3X9Z4 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pcf11G3X9Z4 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pcf11G3X9Z4 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pcf11G3X9Z4 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pcf11G3X9Z4 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pcf11G3X9Z4 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pcf11G3X9Z4 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pcf11G3X9Z4 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pcf11G3X9Z4 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pcf11G3X9Z4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pcf11G3X9Z4 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pcf11G3X9Z4 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pcf11G3X9Z4 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pcf11G3X9Z4 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pcf11G3X9Z4 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pcf11G3X9Z4 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pcf11G3X9Z4 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pcf11G3X9Z4 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pcf11G3X9Z4 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pcf11G3X9Z4 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pcf11G3X9Z4 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pcf11G3X9Z4 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pcf11G3X9Z4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pcf11G3X9Z4 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pcf11G3X9Z4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pcf11G3X9Z4 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pcf11G3X9Z4 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pcf11G3X9Z4 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pcf11G3X9Z4 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pcf11G3X9Z4 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pcf11G3X9Z4 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pcf11G3X9Z4 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pcf11G3X9Z4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pcf11G3X9Z4 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pcf11G3X9Z4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pcf11G3X9Z4 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms