Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmn1r58G3X9U3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r58G3X9U3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r58G3X9U3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r58G3X9U3 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r58G3X9U3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r58G3X9U3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r58G3X9U3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r58G3X9U3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r58G3X9U3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r58G3X9U3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r58G3X9U3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r58G3X9U3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r58G3X9U3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r58G3X9U3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r58G3X9U3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r58G3X9U3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r58G3X9U3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r58G3X9U3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r58G3X9U3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r58G3X9U3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r58G3X9U3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r58G3X9U3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r58G3X9U3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r58G3X9U3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r58G3X9U3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r58G3X9U3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r58G3X9U3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r58G3X9U3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r58G3X9U3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r58G3X9U3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r58G3X9U3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r58G3X9U3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r58G3X9U3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r58G3X9U3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r58G3X9U3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r58G3X9U3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r58G3X9U3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r58G3X9U3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r58G3X9U3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r58G3X9U3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r58G3X9U3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r58G3X9U3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r58G3X9U3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r58G3X9U3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r58G3X9U3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r58G3X9U3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r58G3X9U3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r58G3X9U3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r58G3X9U3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r58G3X9U3 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r58G3X9U3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r58G3X9U3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r58G3X9U3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r58G3X9U3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms