Protein–RNA interactions for Protein: G3X9M3

Hmgxb3, HMG box domain-containing 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgxb3G3X9M3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hmgxb3G3X9M3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms