Protein–RNA interactions for Protein: G3X992

Msl3l2, MSL3-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl3l2G3X992 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Msl3l2G3X992 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msl3l2G3X992 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msl3l2G3X992 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Msl3l2G3X992 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msl3l2G3X992 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msl3l2G3X992 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msl3l2G3X992 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msl3l2G3X992 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msl3l2G3X992 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msl3l2G3X992 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msl3l2G3X992 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msl3l2G3X992 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msl3l2G3X992 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msl3l2G3X992 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msl3l2G3X992 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msl3l2G3X992 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msl3l2G3X992 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msl3l2G3X992 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msl3l2G3X992 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msl3l2G3X992 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msl3l2G3X992 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msl3l2G3X992 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msl3l2G3X992 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msl3l2G3X992 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Msl3l2G3X992 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Msl3l2G3X992 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msl3l2G3X992 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Msl3l2G3X992 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Msl3l2G3X992 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msl3l2G3X992 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msl3l2G3X992 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msl3l2G3X992 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msl3l2G3X992 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msl3l2G3X992 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msl3l2G3X992 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msl3l2G3X992 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msl3l2G3X992 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msl3l2G3X992 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msl3l2G3X992 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msl3l2G3X992 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msl3l2G3X992 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msl3l2G3X992 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msl3l2G3X992 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msl3l2G3X992 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msl3l2G3X992 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msl3l2G3X992 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msl3l2G3X992 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msl3l2G3X992 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msl3l2G3X992 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msl3l2G3X992 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msl3l2G3X992 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msl3l2G3X992 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msl3l2G3X992 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msl3l2G3X992 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msl3l2G3X992 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Msl3l2G3X992 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msl3l2G3X992 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Msl3l2G3X992 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Msl3l2G3X992 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msl3l2G3X992 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Msl3l2G3X992 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msl3l2G3X992 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msl3l2G3X992 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msl3l2G3X992 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msl3l2G3X992 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msl3l2G3X992 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msl3l2G3X992 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msl3l2G3X992 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msl3l2G3X992 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msl3l2G3X992 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msl3l2G3X992 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msl3l2G3X992 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msl3l2G3X992 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msl3l2G3X992 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msl3l2G3X992 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msl3l2G3X992 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msl3l2G3X992 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msl3l2G3X992 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msl3l2G3X992 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msl3l2G3X992 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msl3l2G3X992 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msl3l2G3X992 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msl3l2G3X992 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msl3l2G3X992 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msl3l2G3X992 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msl3l2G3X992 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msl3l2G3X992 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msl3l2G3X992 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msl3l2G3X992 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msl3l2G3X992 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msl3l2G3X992 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msl3l2G3X992 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msl3l2G3X992 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msl3l2G3X992 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msl3l2G3X992 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msl3l2G3X992 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msl3l2G3X992 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msl3l2G3X992 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Msl3l2G3X992 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms