Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ScaperF8VQ70 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ScaperF8VQ70 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ScaperF8VQ70 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ScaperF8VQ70 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ScaperF8VQ70 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ScaperF8VQ70 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ScaperF8VQ70 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ScaperF8VQ70 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ScaperF8VQ70 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ScaperF8VQ70 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ScaperF8VQ70 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ScaperF8VQ70 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ScaperF8VQ70 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ScaperF8VQ70 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ScaperF8VQ70 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ScaperF8VQ70 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ScaperF8VQ70 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ScaperF8VQ70 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ScaperF8VQ70 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ScaperF8VQ70 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ScaperF8VQ70 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ScaperF8VQ70 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ScaperF8VQ70 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ScaperF8VQ70 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ScaperF8VQ70 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ScaperF8VQ70 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ScaperF8VQ70 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ScaperF8VQ70 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ScaperF8VQ70 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ScaperF8VQ70 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ScaperF8VQ70 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ScaperF8VQ70 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ScaperF8VQ70 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ScaperF8VQ70 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ScaperF8VQ70 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ScaperF8VQ70 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ScaperF8VQ70 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ScaperF8VQ70 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ScaperF8VQ70 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ScaperF8VQ70 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ScaperF8VQ70 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ScaperF8VQ70 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ScaperF8VQ70 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ScaperF8VQ70 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ScaperF8VQ70 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ScaperF8VQ70 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ScaperF8VQ70 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ScaperF8VQ70 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ScaperF8VQ70 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ScaperF8VQ70 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ScaperF8VQ70 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ScaperF8VQ70 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ScaperF8VQ70 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ScaperF8VQ70 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ScaperF8VQ70 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ScaperF8VQ70 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ScaperF8VQ70 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ScaperF8VQ70 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ScaperF8VQ70 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ScaperF8VQ70 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ScaperF8VQ70 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ScaperF8VQ70 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ScaperF8VQ70 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ScaperF8VQ70 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ScaperF8VQ70 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ScaperF8VQ70 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ScaperF8VQ70 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ScaperF8VQ70 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ScaperF8VQ70 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ScaperF8VQ70 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ScaperF8VQ70 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ScaperF8VQ70 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ScaperF8VQ70 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ScaperF8VQ70 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ScaperF8VQ70 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ScaperF8VQ70 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ScaperF8VQ70 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ScaperF8VQ70 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ScaperF8VQ70 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ScaperF8VQ70 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ScaperF8VQ70 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ScaperF8VQ70 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ScaperF8VQ70 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ScaperF8VQ70 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ScaperF8VQ70 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ScaperF8VQ70 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ScaperF8VQ70 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ScaperF8VQ70 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ScaperF8VQ70 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ScaperF8VQ70 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ScaperF8VQ70 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ScaperF8VQ70 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ScaperF8VQ70 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ScaperF8VQ70 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ScaperF8VQ70 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ScaperF8VQ70 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ScaperF8VQ70 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ScaperF8VQ70 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ScaperF8VQ70 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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