Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ercc6F8VPZ5 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ercc6F8VPZ5 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ercc6F8VPZ5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ercc6F8VPZ5 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ercc6F8VPZ5 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ercc6F8VPZ5 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ercc6F8VPZ5 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ercc6F8VPZ5 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ercc6F8VPZ5 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ercc6F8VPZ5 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ercc6F8VPZ5 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
Ercc6F8VPZ5 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ercc6F8VPZ5 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ercc6F8VPZ5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ercc6F8VPZ5 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ercc6F8VPZ5 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Ercc6F8VPZ5 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ercc6F8VPZ5 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ercc6F8VPZ5 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ercc6F8VPZ5 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ercc6F8VPZ5 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ercc6F8VPZ5 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ercc6F8VPZ5 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ercc6F8VPZ5 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ercc6F8VPZ5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ercc6F8VPZ5 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ercc6F8VPZ5 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Ercc6F8VPZ5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ercc6F8VPZ5 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Ercc6F8VPZ5 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ercc6F8VPZ5 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ercc6F8VPZ5 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ercc6F8VPZ5 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ercc6F8VPZ5 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ercc6F8VPZ5 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ercc6F8VPZ5 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ercc6F8VPZ5 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ercc6F8VPZ5 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ercc6F8VPZ5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ercc6F8VPZ5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ercc6F8VPZ5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ercc6F8VPZ5 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ercc6F8VPZ5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ercc6F8VPZ5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ercc6F8VPZ5 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Ercc6F8VPZ5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ercc6F8VPZ5 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ercc6F8VPZ5 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ercc6F8VPZ5 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ercc6F8VPZ5 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ercc6F8VPZ5 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ercc6F8VPZ5 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ercc6F8VPZ5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ercc6F8VPZ5 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ercc6F8VPZ5 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ercc6F8VPZ5 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ercc6F8VPZ5 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Ercc6F8VPZ5 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ercc6F8VPZ5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ercc6F8VPZ5 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ercc6F8VPZ5 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ercc6F8VPZ5 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ercc6F8VPZ5 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ercc6F8VPZ5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ercc6F8VPZ5 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ercc6F8VPZ5 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ercc6F8VPZ5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ercc6F8VPZ5 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ercc6F8VPZ5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ercc6F8VPZ5 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ercc6F8VPZ5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ercc6F8VPZ5 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ercc6F8VPZ5 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ercc6F8VPZ5 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ercc6F8VPZ5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Ercc6F8VPZ5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
Ercc6F8VPZ5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ercc6F8VPZ5 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ercc6F8VPZ5 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ercc6F8VPZ5 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Ercc6F8VPZ5 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ercc6F8VPZ5 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ercc6F8VPZ5 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ercc6F8VPZ5 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ercc6F8VPZ5 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ercc6F8VPZ5 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ercc6F8VPZ5 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ercc6F8VPZ5 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ercc6F8VPZ5 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ercc6F8VPZ5 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ercc6F8VPZ5 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ercc6F8VPZ5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ercc6F8VPZ5 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ercc6F8VPZ5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ercc6F8VPZ5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ercc6F8VPZ5 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ercc6F8VPZ5 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Ercc6F8VPZ5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Ercc6F8VPZ5 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms