Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp9yF8VPU6 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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Usp9yF8VPU6 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp9yF8VPU6 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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