Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Farp1F8VPU2 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Farp1F8VPU2 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms