Protein–RNA interactions for Protein: F8VPK8

Pcdh9, Protocadherin 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh9F8VPK8 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pcdh9F8VPK8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pcdh9F8VPK8 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pcdh9F8VPK8 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pcdh9F8VPK8 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pcdh9F8VPK8 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pcdh9F8VPK8 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pcdh9F8VPK8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pcdh9F8VPK8 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Pcdh9F8VPK8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pcdh9F8VPK8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pcdh9F8VPK8 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pcdh9F8VPK8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pcdh9F8VPK8 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pcdh9F8VPK8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pcdh9F8VPK8 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pcdh9F8VPK8 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pcdh9F8VPK8 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Pcdh9F8VPK8 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pcdh9F8VPK8 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pcdh9F8VPK8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pcdh9F8VPK8 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pcdh9F8VPK8 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pcdh9F8VPK8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pcdh9F8VPK8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pcdh9F8VPK8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pcdh9F8VPK8 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pcdh9F8VPK8 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pcdh9F8VPK8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pcdh9F8VPK8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pcdh9F8VPK8 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pcdh9F8VPK8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pcdh9F8VPK8 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pcdh9F8VPK8 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pcdh9F8VPK8 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pcdh9F8VPK8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pcdh9F8VPK8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pcdh9F8VPK8 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pcdh9F8VPK8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pcdh9F8VPK8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pcdh9F8VPK8 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pcdh9F8VPK8 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pcdh9F8VPK8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pcdh9F8VPK8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pcdh9F8VPK8 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pcdh9F8VPK8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pcdh9F8VPK8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pcdh9F8VPK8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pcdh9F8VPK8 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pcdh9F8VPK8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pcdh9F8VPK8 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pcdh9F8VPK8 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pcdh9F8VPK8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pcdh9F8VPK8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pcdh9F8VPK8 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pcdh9F8VPK8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pcdh9F8VPK8 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pcdh9F8VPK8 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pcdh9F8VPK8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pcdh9F8VPK8 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pcdh9F8VPK8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pcdh9F8VPK8 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Pcdh9F8VPK8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pcdh9F8VPK8 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pcdh9F8VPK8 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pcdh9F8VPK8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pcdh9F8VPK8 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pcdh9F8VPK8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pcdh9F8VPK8 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pcdh9F8VPK8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pcdh9F8VPK8 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Pcdh9F8VPK8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pcdh9F8VPK8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Pcdh9F8VPK8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pcdh9F8VPK8 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pcdh9F8VPK8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pcdh9F8VPK8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pcdh9F8VPK8 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pcdh9F8VPK8 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pcdh9F8VPK8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pcdh9F8VPK8 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pcdh9F8VPK8 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pcdh9F8VPK8 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pcdh9F8VPK8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pcdh9F8VPK8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pcdh9F8VPK8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pcdh9F8VPK8 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pcdh9F8VPK8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pcdh9F8VPK8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pcdh9F8VPK8 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pcdh9F8VPK8 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pcdh9F8VPK8 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pcdh9F8VPK8 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pcdh9F8VPK8 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pcdh9F8VPK8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pcdh9F8VPK8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pcdh9F8VPK8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pcdh9F8VPK8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Pcdh9F8VPK8 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pcdh9F8VPK8 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms