Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm28048F7BCN0 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm28048F7BCN0 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm28048F7BCN0 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm28048F7BCN0 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm28048F7BCN0 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm28048F7BCN0 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm28048F7BCN0 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm28048F7BCN0 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm28048F7BCN0 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm28048F7BCN0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm28048F7BCN0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm28048F7BCN0 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm28048F7BCN0 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm28048F7BCN0 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm28048F7BCN0 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm28048F7BCN0 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm28048F7BCN0 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm28048F7BCN0 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm28048F7BCN0 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm28048F7BCN0 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm28048F7BCN0 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm28048F7BCN0 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm28048F7BCN0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm28048F7BCN0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm28048F7BCN0 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm28048F7BCN0 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm28048F7BCN0 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm28048F7BCN0 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm28048F7BCN0 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm28048F7BCN0 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm28048F7BCN0 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm28048F7BCN0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm28048F7BCN0 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm28048F7BCN0 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm28048F7BCN0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm28048F7BCN0 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm28048F7BCN0 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm28048F7BCN0 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm28048F7BCN0 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm28048F7BCN0 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm28048F7BCN0 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28048F7BCN0 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28048F7BCN0 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28048F7BCN0 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28048F7BCN0 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28048F7BCN0 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28048F7BCN0 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28048F7BCN0 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28048F7BCN0 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28048F7BCN0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28048F7BCN0 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28048F7BCN0 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28048F7BCN0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28048F7BCN0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28048F7BCN0 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28048F7BCN0 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28048F7BCN0 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28048F7BCN0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28048F7BCN0 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28048F7BCN0 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28048F7BCN0 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28048F7BCN0 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28048F7BCN0 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28048F7BCN0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28048F7BCN0 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28048F7BCN0 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28048F7BCN0 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm28048F7BCN0 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm28048F7BCN0 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm28048F7BCN0 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm28048F7BCN0 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm28048F7BCN0 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm28048F7BCN0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm28048F7BCN0 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm28048F7BCN0 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm28048F7BCN0 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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