Protein–RNA interactions for Protein: F6ZIS7

Rarres1, Retinoic acid receptor responder (tazarotene-induced) 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rarres1F6ZIS7 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rarres1F6ZIS7 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rarres1F6ZIS7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rarres1F6ZIS7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rarres1F6ZIS7 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rarres1F6ZIS7 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rarres1F6ZIS7 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rarres1F6ZIS7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rarres1F6ZIS7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rarres1F6ZIS7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rarres1F6ZIS7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rarres1F6ZIS7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rarres1F6ZIS7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rarres1F6ZIS7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rarres1F6ZIS7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rarres1F6ZIS7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rarres1F6ZIS7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rarres1F6ZIS7 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rarres1F6ZIS7 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rarres1F6ZIS7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rarres1F6ZIS7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rarres1F6ZIS7 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rarres1F6ZIS7 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rarres1F6ZIS7 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rarres1F6ZIS7 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rarres1F6ZIS7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rarres1F6ZIS7 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rarres1F6ZIS7 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rarres1F6ZIS7 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rarres1F6ZIS7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rarres1F6ZIS7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rarres1F6ZIS7 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rarres1F6ZIS7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rarres1F6ZIS7 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rarres1F6ZIS7 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rarres1F6ZIS7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rarres1F6ZIS7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rarres1F6ZIS7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rarres1F6ZIS7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rarres1F6ZIS7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rarres1F6ZIS7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rarres1F6ZIS7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rarres1F6ZIS7 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rarres1F6ZIS7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rarres1F6ZIS7 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rarres1F6ZIS7 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rarres1F6ZIS7 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rarres1F6ZIS7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rarres1F6ZIS7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rarres1F6ZIS7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rarres1F6ZIS7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rarres1F6ZIS7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Rarres1F6ZIS7 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rarres1F6ZIS7 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rarres1F6ZIS7 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rarres1F6ZIS7 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rarres1F6ZIS7 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rarres1F6ZIS7 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rarres1F6ZIS7 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rarres1F6ZIS7 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rarres1F6ZIS7 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rarres1F6ZIS7 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rarres1F6ZIS7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rarres1F6ZIS7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rarres1F6ZIS7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rarres1F6ZIS7 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rarres1F6ZIS7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rarres1F6ZIS7 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rarres1F6ZIS7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rarres1F6ZIS7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rarres1F6ZIS7 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rarres1F6ZIS7 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rarres1F6ZIS7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rarres1F6ZIS7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rarres1F6ZIS7 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rarres1F6ZIS7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rarres1F6ZIS7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rarres1F6ZIS7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rarres1F6ZIS7 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rarres1F6ZIS7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rarres1F6ZIS7 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rarres1F6ZIS7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rarres1F6ZIS7 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rarres1F6ZIS7 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rarres1F6ZIS7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rarres1F6ZIS7 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rarres1F6ZIS7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rarres1F6ZIS7 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rarres1F6ZIS7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rarres1F6ZIS7 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rarres1F6ZIS7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rarres1F6ZIS7 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rarres1F6ZIS7 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rarres1F6ZIS7 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rarres1F6ZIS7 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rarres1F6ZIS7 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rarres1F6ZIS7 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rarres1F6ZIS7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rarres1F6ZIS7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rarres1F6ZIS7 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms