Protein–RNA interactions for Protein: F6XQQ1

Gm10378, Predicted gene 10378 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10378F6XQQ1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm10378F6XQQ1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms