Protein–RNA interactions for Protein: F6XGJ4

Gm17093, Predicted gene 17093 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17093F6XGJ4 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm17093F6XGJ4 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm17093F6XGJ4 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17093F6XGJ4 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17093F6XGJ4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17093F6XGJ4 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17093F6XGJ4 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17093F6XGJ4 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17093F6XGJ4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17093F6XGJ4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17093F6XGJ4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17093F6XGJ4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17093F6XGJ4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17093F6XGJ4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17093F6XGJ4 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17093F6XGJ4 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17093F6XGJ4 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17093F6XGJ4 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17093F6XGJ4 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17093F6XGJ4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17093F6XGJ4 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17093F6XGJ4 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17093F6XGJ4 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm17093F6XGJ4 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm17093F6XGJ4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm17093F6XGJ4 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm17093F6XGJ4 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm17093F6XGJ4 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm17093F6XGJ4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm17093F6XGJ4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm17093F6XGJ4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm17093F6XGJ4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm17093F6XGJ4 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm17093F6XGJ4 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm17093F6XGJ4 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm17093F6XGJ4 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm17093F6XGJ4 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm17093F6XGJ4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm17093F6XGJ4 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm17093F6XGJ4 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm17093F6XGJ4 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm17093F6XGJ4 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm17093F6XGJ4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm17093F6XGJ4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm17093F6XGJ4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm17093F6XGJ4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm17093F6XGJ4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm17093F6XGJ4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm17093F6XGJ4 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm17093F6XGJ4 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm17093F6XGJ4 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm17093F6XGJ4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm17093F6XGJ4 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm17093F6XGJ4 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm17093F6XGJ4 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm17093F6XGJ4 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm17093F6XGJ4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm17093F6XGJ4 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm17093F6XGJ4 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm17093F6XGJ4 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm17093F6XGJ4 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm17093F6XGJ4 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm17093F6XGJ4 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm17093F6XGJ4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm17093F6XGJ4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm17093F6XGJ4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm17093F6XGJ4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm17093F6XGJ4 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm17093F6XGJ4 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm17093F6XGJ4 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm17093F6XGJ4 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm17093F6XGJ4 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm17093F6XGJ4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm17093F6XGJ4 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm17093F6XGJ4 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm17093F6XGJ4 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm17093F6XGJ4 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm17093F6XGJ4 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm17093F6XGJ4 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm17093F6XGJ4 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm17093F6XGJ4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm17093F6XGJ4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm17093F6XGJ4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm17093F6XGJ4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm17093F6XGJ4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm17093F6XGJ4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm17093F6XGJ4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm17093F6XGJ4 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm17093F6XGJ4 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm17093F6XGJ4 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm17093F6XGJ4 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm17093F6XGJ4 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm17093F6XGJ4 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm17093F6XGJ4 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm17093F6XGJ4 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm17093F6XGJ4 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm17093F6XGJ4 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm17093F6XGJ4 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm17093F6XGJ4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm17093F6XGJ4 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms