Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syngap1F6SEU4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syngap1F6SEU4 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syngap1F6SEU4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syngap1F6SEU4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syngap1F6SEU4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syngap1F6SEU4 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syngap1F6SEU4 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syngap1F6SEU4 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syngap1F6SEU4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syngap1F6SEU4 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syngap1F6SEU4 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syngap1F6SEU4 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syngap1F6SEU4 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syngap1F6SEU4 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syngap1F6SEU4 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syngap1F6SEU4 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syngap1F6SEU4 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syngap1F6SEU4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syngap1F6SEU4 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syngap1F6SEU4 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syngap1F6SEU4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syngap1F6SEU4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syngap1F6SEU4 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syngap1F6SEU4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syngap1F6SEU4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syngap1F6SEU4 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syngap1F6SEU4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syngap1F6SEU4 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syngap1F6SEU4 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syngap1F6SEU4 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syngap1F6SEU4 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syngap1F6SEU4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syngap1F6SEU4 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syngap1F6SEU4 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syngap1F6SEU4 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syngap1F6SEU4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syngap1F6SEU4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syngap1F6SEU4 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syngap1F6SEU4 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Syngap1F6SEU4 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syngap1F6SEU4 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Syngap1F6SEU4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Syngap1F6SEU4 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syngap1F6SEU4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syngap1F6SEU4 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syngap1F6SEU4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syngap1F6SEU4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syngap1F6SEU4 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syngap1F6SEU4 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syngap1F6SEU4 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syngap1F6SEU4 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syngap1F6SEU4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syngap1F6SEU4 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syngap1F6SEU4 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syngap1F6SEU4 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syngap1F6SEU4 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syngap1F6SEU4 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Syngap1F6SEU4 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syngap1F6SEU4 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syngap1F6SEU4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syngap1F6SEU4 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Syngap1F6SEU4 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syngap1F6SEU4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syngap1F6SEU4 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms