Protein–RNA interactions for Protein: F2Z461

Herc6, E3 ISG15--protein ligase Herc6, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc6F2Z461 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Herc6F2Z461 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Herc6F2Z461 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Herc6F2Z461 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Herc6F2Z461 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Herc6F2Z461 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Herc6F2Z461 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Herc6F2Z461 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Herc6F2Z461 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Herc6F2Z461 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Herc6F2Z461 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Herc6F2Z461 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Herc6F2Z461 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Herc6F2Z461 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Herc6F2Z461 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Herc6F2Z461 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Herc6F2Z461 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Herc6F2Z461 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Herc6F2Z461 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Herc6F2Z461 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Herc6F2Z461 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Herc6F2Z461 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Herc6F2Z461 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Herc6F2Z461 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Herc6F2Z461 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Herc6F2Z461 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Herc6F2Z461 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Herc6F2Z461 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Herc6F2Z461 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Herc6F2Z461 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Herc6F2Z461 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Herc6F2Z461 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Herc6F2Z461 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Herc6F2Z461 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Herc6F2Z461 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Herc6F2Z461 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Herc6F2Z461 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Herc6F2Z461 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Herc6F2Z461 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Herc6F2Z461 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Herc6F2Z461 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Herc6F2Z461 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Herc6F2Z461 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Herc6F2Z461 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Herc6F2Z461 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Herc6F2Z461 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Herc6F2Z461 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Herc6F2Z461 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Herc6F2Z461 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Herc6F2Z461 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Herc6F2Z461 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Herc6F2Z461 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Herc6F2Z461 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Herc6F2Z461 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Herc6F2Z461 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Herc6F2Z461 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Herc6F2Z461 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Herc6F2Z461 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Herc6F2Z461 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Herc6F2Z461 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Herc6F2Z461 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Herc6F2Z461 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Herc6F2Z461 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Herc6F2Z461 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Herc6F2Z461 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Herc6F2Z461 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Herc6F2Z461 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Herc6F2Z461 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Herc6F2Z461 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Herc6F2Z461 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Herc6F2Z461 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Herc6F2Z461 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Herc6F2Z461 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Herc6F2Z461 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Herc6F2Z461 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Herc6F2Z461 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Herc6F2Z461 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Herc6F2Z461 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Herc6F2Z461 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Herc6F2Z461 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Herc6F2Z461 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Herc6F2Z461 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Herc6F2Z461 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Herc6F2Z461 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Herc6F2Z461 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Herc6F2Z461 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Herc6F2Z461 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Herc6F2Z461 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Herc6F2Z461 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Herc6F2Z461 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Herc6F2Z461 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Herc6F2Z461 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Herc6F2Z461 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Herc6F2Z461 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms