Protein–RNA interactions for Protein: E9QA15

Cald1, Caldesmon 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cald1E9QA15 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cald1E9QA15 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cald1E9QA15 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cald1E9QA15 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cald1E9QA15 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cald1E9QA15 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cald1E9QA15 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cald1E9QA15 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cald1E9QA15 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cald1E9QA15 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cald1E9QA15 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Cald1E9QA15 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cald1E9QA15 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cald1E9QA15 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cald1E9QA15 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cald1E9QA15 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cald1E9QA15 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cald1E9QA15 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cald1E9QA15 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cald1E9QA15 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cald1E9QA15 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cald1E9QA15 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cald1E9QA15 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cald1E9QA15 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cald1E9QA15 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cald1E9QA15 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cald1E9QA15 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cald1E9QA15 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cald1E9QA15 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cald1E9QA15 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cald1E9QA15 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cald1E9QA15 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cald1E9QA15 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cald1E9QA15 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cald1E9QA15 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cald1E9QA15 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cald1E9QA15 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cald1E9QA15 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cald1E9QA15 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cald1E9QA15 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cald1E9QA15 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cald1E9QA15 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cald1E9QA15 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cald1E9QA15 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cald1E9QA15 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cald1E9QA15 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cald1E9QA15 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cald1E9QA15 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cald1E9QA15 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cald1E9QA15 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cald1E9QA15 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cald1E9QA15 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cald1E9QA15 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cald1E9QA15 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cald1E9QA15 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cald1E9QA15 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cald1E9QA15 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cald1E9QA15 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cald1E9QA15 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cald1E9QA15 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cald1E9QA15 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cald1E9QA15 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cald1E9QA15 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cald1E9QA15 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cald1E9QA15 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cald1E9QA15 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cald1E9QA15 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cald1E9QA15 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cald1E9QA15 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cald1E9QA15 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cald1E9QA15 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cald1E9QA15 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cald1E9QA15 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cald1E9QA15 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cald1E9QA15 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cald1E9QA15 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cald1E9QA15 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cald1E9QA15 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cald1E9QA15 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cald1E9QA15 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cald1E9QA15 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cald1E9QA15 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cald1E9QA15 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cald1E9QA15 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cald1E9QA15 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cald1E9QA15 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cald1E9QA15 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cald1E9QA15 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cald1E9QA15 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cald1E9QA15 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cald1E9QA15 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cald1E9QA15 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cald1E9QA15 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cald1E9QA15 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cald1E9QA15 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cald1E9QA15 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cald1E9QA15 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cald1E9QA15 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cald1E9QA15 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cald1E9QA15 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms