Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U8

Ccdc74a, Coiled-coil domain-containing 74A, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc74aE9Q9U8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc74aE9Q9U8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms