Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9P8

Rdh16f1, RDH16 family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f1E9Q9P8 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh16f1E9Q9P8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh16f1E9Q9P8 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh16f1E9Q9P8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh16f1E9Q9P8 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh16f1E9Q9P8 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh16f1E9Q9P8 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh16f1E9Q9P8 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh16f1E9Q9P8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh16f1E9Q9P8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh16f1E9Q9P8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh16f1E9Q9P8 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh16f1E9Q9P8 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh16f1E9Q9P8 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh16f1E9Q9P8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh16f1E9Q9P8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh16f1E9Q9P8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh16f1E9Q9P8 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh16f1E9Q9P8 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh16f1E9Q9P8 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rdh16f1E9Q9P8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rdh16f1E9Q9P8 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Rdh16f1E9Q9P8 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rdh16f1E9Q9P8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rdh16f1E9Q9P8 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rdh16f1E9Q9P8 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rdh16f1E9Q9P8 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rdh16f1E9Q9P8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rdh16f1E9Q9P8 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rdh16f1E9Q9P8 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rdh16f1E9Q9P8 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rdh16f1E9Q9P8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rdh16f1E9Q9P8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rdh16f1E9Q9P8 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rdh16f1E9Q9P8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rdh16f1E9Q9P8 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rdh16f1E9Q9P8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rdh16f1E9Q9P8 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rdh16f1E9Q9P8 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rdh16f1E9Q9P8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rdh16f1E9Q9P8 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rdh16f1E9Q9P8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rdh16f1E9Q9P8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rdh16f1E9Q9P8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh16f1E9Q9P8 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh16f1E9Q9P8 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh16f1E9Q9P8 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh16f1E9Q9P8 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh16f1E9Q9P8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh16f1E9Q9P8 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rdh16f1E9Q9P8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh16f1E9Q9P8 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh16f1E9Q9P8 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh16f1E9Q9P8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh16f1E9Q9P8 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh16f1E9Q9P8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh16f1E9Q9P8 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh16f1E9Q9P8 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh16f1E9Q9P8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh16f1E9Q9P8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh16f1E9Q9P8 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh16f1E9Q9P8 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh16f1E9Q9P8 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh16f1E9Q9P8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh16f1E9Q9P8 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh16f1E9Q9P8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rdh16f1E9Q9P8 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rdh16f1E9Q9P8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh16f1E9Q9P8 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh16f1E9Q9P8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh16f1E9Q9P8 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh16f1E9Q9P8 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh16f1E9Q9P8 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh16f1E9Q9P8 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh16f1E9Q9P8 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rdh16f1E9Q9P8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rdh16f1E9Q9P8 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rdh16f1E9Q9P8 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rdh16f1E9Q9P8 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rdh16f1E9Q9P8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rdh16f1E9Q9P8 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rdh16f1E9Q9P8 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rdh16f1E9Q9P8 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rdh16f1E9Q9P8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rdh16f1E9Q9P8 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rdh16f1E9Q9P8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rdh16f1E9Q9P8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rdh16f1E9Q9P8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rdh16f1E9Q9P8 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rdh16f1E9Q9P8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rdh16f1E9Q9P8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rdh16f1E9Q9P8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rdh16f1E9Q9P8 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rdh16f1E9Q9P8 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rdh16f1E9Q9P8 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rdh16f1E9Q9P8 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rdh16f1E9Q9P8 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rdh16f1E9Q9P8 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rdh16f1E9Q9P8 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rdh16f1E9Q9P8 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms