Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
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TrdnE9Q9K5 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TrdnE9Q9K5 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TrdnE9Q9K5 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TrdnE9Q9K5 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TrdnE9Q9K5 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
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TrdnE9Q9K5 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TrdnE9Q9K5 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TrdnE9Q9K5 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
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TrdnE9Q9K5 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
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TrdnE9Q9K5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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TrdnE9Q9K5 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TrdnE9Q9K5 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TrdnE9Q9K5 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TrdnE9Q9K5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TrdnE9Q9K5 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TrdnE9Q9K5 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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TrdnE9Q9K5 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TrdnE9Q9K5 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TrdnE9Q9K5 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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TrdnE9Q9K5 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TrdnE9Q9K5 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TrdnE9Q9K5 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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TrdnE9Q9K5 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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TrdnE9Q9K5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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TrdnE9Q9K5 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TrdnE9Q9K5 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TrdnE9Q9K5 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TrdnE9Q9K5 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TrdnE9Q9K5 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TrdnE9Q9K5 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TrdnE9Q9K5 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TrdnE9Q9K5 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TrdnE9Q9K5 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TrdnE9Q9K5 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TrdnE9Q9K5 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TrdnE9Q9K5 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TrdnE9Q9K5 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TrdnE9Q9K5 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
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TrdnE9Q9K5 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms