Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9D8

Ankrd35, Ankyrin repeat domain 35, mousemouse

Predictions only

Length 996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd35E9Q9D8 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ankrd35E9Q9D8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ankrd35E9Q9D8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ankrd35E9Q9D8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ankrd35E9Q9D8 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ankrd35E9Q9D8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ankrd35E9Q9D8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ankrd35E9Q9D8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ankrd35E9Q9D8 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ankrd35E9Q9D8 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ankrd35E9Q9D8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ankrd35E9Q9D8 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ankrd35E9Q9D8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ankrd35E9Q9D8 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Ankrd35E9Q9D8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ankrd35E9Q9D8 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ankrd35E9Q9D8 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ankrd35E9Q9D8 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ankrd35E9Q9D8 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ankrd35E9Q9D8 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ankrd35E9Q9D8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ankrd35E9Q9D8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ankrd35E9Q9D8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ankrd35E9Q9D8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ankrd35E9Q9D8 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ankrd35E9Q9D8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ankrd35E9Q9D8 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ankrd35E9Q9D8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ankrd35E9Q9D8 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ankrd35E9Q9D8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ankrd35E9Q9D8 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ankrd35E9Q9D8 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Ankrd35E9Q9D8 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Ankrd35E9Q9D8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ankrd35E9Q9D8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ankrd35E9Q9D8 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ankrd35E9Q9D8 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ankrd35E9Q9D8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ankrd35E9Q9D8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ankrd35E9Q9D8 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ankrd35E9Q9D8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ankrd35E9Q9D8 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ankrd35E9Q9D8 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ankrd35E9Q9D8 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ankrd35E9Q9D8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ankrd35E9Q9D8 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ankrd35E9Q9D8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ankrd35E9Q9D8 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ankrd35E9Q9D8 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Ankrd35E9Q9D8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ankrd35E9Q9D8 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ankrd35E9Q9D8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ankrd35E9Q9D8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ankrd35E9Q9D8 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ankrd35E9Q9D8 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ankrd35E9Q9D8 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ankrd35E9Q9D8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ankrd35E9Q9D8 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ankrd35E9Q9D8 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ankrd35E9Q9D8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ankrd35E9Q9D8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ankrd35E9Q9D8 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ankrd35E9Q9D8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ankrd35E9Q9D8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ankrd35E9Q9D8 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ankrd35E9Q9D8 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Ankrd35E9Q9D8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ankrd35E9Q9D8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ankrd35E9Q9D8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ankrd35E9Q9D8 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ankrd35E9Q9D8 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ankrd35E9Q9D8 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ankrd35E9Q9D8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ankrd35E9Q9D8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ankrd35E9Q9D8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ankrd35E9Q9D8 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ankrd35E9Q9D8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ankrd35E9Q9D8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Ankrd35E9Q9D8 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ankrd35E9Q9D8 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Ankrd35E9Q9D8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ankrd35E9Q9D8 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ankrd35E9Q9D8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ankrd35E9Q9D8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ankrd35E9Q9D8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Ankrd35E9Q9D8 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ankrd35E9Q9D8 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ankrd35E9Q9D8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ankrd35E9Q9D8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ankrd35E9Q9D8 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ankrd35E9Q9D8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ankrd35E9Q9D8 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ankrd35E9Q9D8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ankrd35E9Q9D8 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ankrd35E9Q9D8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ankrd35E9Q9D8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ankrd35E9Q9D8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ankrd35E9Q9D8 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Ankrd35E9Q9D8 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Ankrd35E9Q9D8 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms