Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Urb2E9Q7L1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Urb2E9Q7L1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Urb2E9Q7L1 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Urb2E9Q7L1 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Urb2E9Q7L1 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Urb2E9Q7L1 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Urb2E9Q7L1 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Urb2E9Q7L1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Urb2E9Q7L1 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Urb2E9Q7L1 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Urb2E9Q7L1 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Urb2E9Q7L1 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Urb2E9Q7L1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Urb2E9Q7L1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Urb2E9Q7L1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Urb2E9Q7L1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Urb2E9Q7L1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Urb2E9Q7L1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Urb2E9Q7L1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Urb2E9Q7L1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Urb2E9Q7L1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Urb2E9Q7L1 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Urb2E9Q7L1 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Urb2E9Q7L1 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Urb2E9Q7L1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Urb2E9Q7L1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Urb2E9Q7L1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Urb2E9Q7L1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Urb2E9Q7L1 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Urb2E9Q7L1 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Urb2E9Q7L1 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Urb2E9Q7L1 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Urb2E9Q7L1 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Urb2E9Q7L1 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Urb2E9Q7L1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Urb2E9Q7L1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Urb2E9Q7L1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Urb2E9Q7L1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Urb2E9Q7L1 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Urb2E9Q7L1 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Urb2E9Q7L1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Urb2E9Q7L1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Urb2E9Q7L1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Urb2E9Q7L1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Urb2E9Q7L1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Urb2E9Q7L1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Urb2E9Q7L1 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Urb2E9Q7L1 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Urb2E9Q7L1 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Urb2E9Q7L1 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Urb2E9Q7L1 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Urb2E9Q7L1 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Urb2E9Q7L1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Urb2E9Q7L1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Urb2E9Q7L1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Urb2E9Q7L1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Urb2E9Q7L1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Urb2E9Q7L1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Urb2E9Q7L1 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Urb2E9Q7L1 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Urb2E9Q7L1 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Urb2E9Q7L1 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Urb2E9Q7L1 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Urb2E9Q7L1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Urb2E9Q7L1 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Urb2E9Q7L1 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Urb2E9Q7L1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Urb2E9Q7L1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Urb2E9Q7L1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Urb2E9Q7L1 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Urb2E9Q7L1 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Urb2E9Q7L1 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Urb2E9Q7L1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Urb2E9Q7L1 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Urb2E9Q7L1 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Urb2E9Q7L1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Urb2E9Q7L1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Urb2E9Q7L1 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Urb2E9Q7L1 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Urb2E9Q7L1 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Urb2E9Q7L1 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Urb2E9Q7L1 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Urb2E9Q7L1 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Urb2E9Q7L1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Urb2E9Q7L1 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Urb2E9Q7L1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Urb2E9Q7L1 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Urb2E9Q7L1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Urb2E9Q7L1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Urb2E9Q7L1 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Urb2E9Q7L1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Urb2E9Q7L1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Urb2E9Q7L1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Urb2E9Q7L1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Urb2E9Q7L1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Urb2E9Q7L1 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Urb2E9Q7L1 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Urb2E9Q7L1 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Urb2E9Q7L1 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms