Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E9

Simc1, SUMO-interacting motifs-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Simc1E9Q6E9 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Simc1E9Q6E9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Simc1E9Q6E9 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Simc1E9Q6E9 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Simc1E9Q6E9 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Simc1E9Q6E9 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Simc1E9Q6E9 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Simc1E9Q6E9 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Simc1E9Q6E9 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Simc1E9Q6E9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Simc1E9Q6E9 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Simc1E9Q6E9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Simc1E9Q6E9 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Simc1E9Q6E9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Simc1E9Q6E9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Simc1E9Q6E9 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Simc1E9Q6E9 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Simc1E9Q6E9 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Simc1E9Q6E9 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Simc1E9Q6E9 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Simc1E9Q6E9 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Simc1E9Q6E9 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Simc1E9Q6E9 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Simc1E9Q6E9 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Simc1E9Q6E9 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Simc1E9Q6E9 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Simc1E9Q6E9 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Simc1E9Q6E9 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Simc1E9Q6E9 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Simc1E9Q6E9 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Simc1E9Q6E9 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Simc1E9Q6E9 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Simc1E9Q6E9 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Simc1E9Q6E9 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Simc1E9Q6E9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Simc1E9Q6E9 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Simc1E9Q6E9 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Simc1E9Q6E9 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Simc1E9Q6E9 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Simc1E9Q6E9 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Simc1E9Q6E9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Simc1E9Q6E9 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Simc1E9Q6E9 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Simc1E9Q6E9 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Simc1E9Q6E9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Simc1E9Q6E9 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Simc1E9Q6E9 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Simc1E9Q6E9 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Simc1E9Q6E9 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Simc1E9Q6E9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Simc1E9Q6E9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Simc1E9Q6E9 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Simc1E9Q6E9 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Simc1E9Q6E9 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Simc1E9Q6E9 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Simc1E9Q6E9 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Simc1E9Q6E9 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Simc1E9Q6E9 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Simc1E9Q6E9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Simc1E9Q6E9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Simc1E9Q6E9 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Simc1E9Q6E9 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Simc1E9Q6E9 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Simc1E9Q6E9 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Simc1E9Q6E9 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Simc1E9Q6E9 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Simc1E9Q6E9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Simc1E9Q6E9 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Simc1E9Q6E9 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Simc1E9Q6E9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Simc1E9Q6E9 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Simc1E9Q6E9 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Simc1E9Q6E9 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Simc1E9Q6E9 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Simc1E9Q6E9 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Simc1E9Q6E9 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Simc1E9Q6E9 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Simc1E9Q6E9 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Simc1E9Q6E9 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Simc1E9Q6E9 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Simc1E9Q6E9 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Simc1E9Q6E9 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Simc1E9Q6E9 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Simc1E9Q6E9 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Simc1E9Q6E9 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Simc1E9Q6E9 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Simc1E9Q6E9 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Simc1E9Q6E9 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Simc1E9Q6E9 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Simc1E9Q6E9 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Simc1E9Q6E9 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Simc1E9Q6E9 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Simc1E9Q6E9 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Simc1E9Q6E9 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Simc1E9Q6E9 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Simc1E9Q6E9 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Simc1E9Q6E9 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Simc1E9Q6E9 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Simc1E9Q6E9 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Simc1E9Q6E9 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms