Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E5

Srsf11, Serine/arginine-rich-splicing factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf11E9Q6E5 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Srsf11E9Q6E5 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Srsf11E9Q6E5 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Srsf11E9Q6E5 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Srsf11E9Q6E5 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Srsf11E9Q6E5 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Srsf11E9Q6E5 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Srsf11E9Q6E5 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Srsf11E9Q6E5 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Srsf11E9Q6E5 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Srsf11E9Q6E5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Srsf11E9Q6E5 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Srsf11E9Q6E5 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Srsf11E9Q6E5 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Srsf11E9Q6E5 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Srsf11E9Q6E5 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Srsf11E9Q6E5 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Srsf11E9Q6E5 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Srsf11E9Q6E5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Srsf11E9Q6E5 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Srsf11E9Q6E5 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Srsf11E9Q6E5 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Srsf11E9Q6E5 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Srsf11E9Q6E5 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Srsf11E9Q6E5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Srsf11E9Q6E5 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Srsf11E9Q6E5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Srsf11E9Q6E5 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Srsf11E9Q6E5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Srsf11E9Q6E5 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Srsf11E9Q6E5 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Srsf11E9Q6E5 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Srsf11E9Q6E5 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Srsf11E9Q6E5 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Srsf11E9Q6E5 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Srsf11E9Q6E5 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Srsf11E9Q6E5 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Srsf11E9Q6E5 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Srsf11E9Q6E5 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Srsf11E9Q6E5 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Srsf11E9Q6E5 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Srsf11E9Q6E5 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Srsf11E9Q6E5 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Srsf11E9Q6E5 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Srsf11E9Q6E5 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Srsf11E9Q6E5 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Srsf11E9Q6E5 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Srsf11E9Q6E5 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Srsf11E9Q6E5 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Srsf11E9Q6E5 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Srsf11E9Q6E5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Srsf11E9Q6E5 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Srsf11E9Q6E5 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Srsf11E9Q6E5 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Srsf11E9Q6E5 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Srsf11E9Q6E5 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Srsf11E9Q6E5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Srsf11E9Q6E5 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Srsf11E9Q6E5 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Srsf11E9Q6E5 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Srsf11E9Q6E5 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Srsf11E9Q6E5 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Srsf11E9Q6E5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Srsf11E9Q6E5 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Srsf11E9Q6E5 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Srsf11E9Q6E5 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Srsf11E9Q6E5 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Srsf11E9Q6E5 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Srsf11E9Q6E5 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Srsf11E9Q6E5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Srsf11E9Q6E5 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Srsf11E9Q6E5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Srsf11E9Q6E5 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Srsf11E9Q6E5 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Srsf11E9Q6E5 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Srsf11E9Q6E5 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Srsf11E9Q6E5 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Srsf11E9Q6E5 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Srsf11E9Q6E5 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Srsf11E9Q6E5 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Srsf11E9Q6E5 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Srsf11E9Q6E5 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Srsf11E9Q6E5 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Srsf11E9Q6E5 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Srsf11E9Q6E5 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Srsf11E9Q6E5 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Srsf11E9Q6E5 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Srsf11E9Q6E5 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Srsf11E9Q6E5 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Srsf11E9Q6E5 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Srsf11E9Q6E5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Srsf11E9Q6E5 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Srsf11E9Q6E5 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Srsf11E9Q6E5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Srsf11E9Q6E5 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Srsf11E9Q6E5 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Srsf11E9Q6E5 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Srsf11E9Q6E5 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Srsf11E9Q6E5 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Srsf11E9Q6E5 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms