Protein–RNA interactions for Protein: E9Q557

Dsp, Desmoplakin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DspE9Q557 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
DspE9Q557 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DspE9Q557 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DspE9Q557 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DspE9Q557 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DspE9Q557 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
DspE9Q557 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
DspE9Q557 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DspE9Q557 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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