Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms