Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
ApobE9Q414 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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