Protein–RNA interactions for Protein: E9Q328

5430401F13Rik, RIKEN cDNA 5430401F13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430401F13RikE9Q328 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
5430401F13RikE9Q328 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms