Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms