Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1I1

Gm3893, Predicted gene 3893, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3893E9Q1I1 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm3893E9Q1I1 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm3893E9Q1I1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm3893E9Q1I1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm3893E9Q1I1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm3893E9Q1I1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm3893E9Q1I1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm3893E9Q1I1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm3893E9Q1I1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm3893E9Q1I1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm3893E9Q1I1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm3893E9Q1I1 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm3893E9Q1I1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm3893E9Q1I1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm3893E9Q1I1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm3893E9Q1I1 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm3893E9Q1I1 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm3893E9Q1I1 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm3893E9Q1I1 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm3893E9Q1I1 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm3893E9Q1I1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm3893E9Q1I1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm3893E9Q1I1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm3893E9Q1I1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm3893E9Q1I1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm3893E9Q1I1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm3893E9Q1I1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm3893E9Q1I1 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm3893E9Q1I1 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm3893E9Q1I1 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm3893E9Q1I1 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm3893E9Q1I1 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm3893E9Q1I1 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm3893E9Q1I1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm3893E9Q1I1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm3893E9Q1I1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm3893E9Q1I1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm3893E9Q1I1 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm3893E9Q1I1 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm3893E9Q1I1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm3893E9Q1I1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
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Gm3893E9Q1I1 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm3893E9Q1I1 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
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Gm3893E9Q1I1 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
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Gm3893E9Q1I1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
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Gm3893E9Q1I1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm3893E9Q1I1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm3893E9Q1I1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm3893E9Q1I1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm3893E9Q1I1 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm3893E9Q1I1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm3893E9Q1I1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm3893E9Q1I1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm3893E9Q1I1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm3893E9Q1I1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
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Gm3893E9Q1I1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm3893E9Q1I1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm3893E9Q1I1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm3893E9Q1I1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm3893E9Q1I1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm3893E9Q1I1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm3893E9Q1I1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm3893E9Q1I1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm3893E9Q1I1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm3893E9Q1I1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm3893E9Q1I1 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm3893E9Q1I1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm3893E9Q1I1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm3893E9Q1I1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm3893E9Q1I1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm3893E9Q1I1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm3893E9Q1I1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm3893E9Q1I1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm3893E9Q1I1 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm3893E9Q1I1 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm3893E9Q1I1 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm3893E9Q1I1 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm3893E9Q1I1 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm3893E9Q1I1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gm3893E9Q1I1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm3893E9Q1I1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm3893E9Q1I1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm3893E9Q1I1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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