Protein–RNA interactions for Protein: E9Q058

Gm3095, Predicted gene 3095, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3095E9Q058 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
Gm3095E9Q058 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm3095E9Q058 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm3095E9Q058 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm3095E9Q058 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm3095E9Q058 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm3095E9Q058 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm3095E9Q058 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms