Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fndc1E9Q043 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fndc1E9Q043 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Fndc1E9Q043 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fndc1E9Q043 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fndc1E9Q043 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fndc1E9Q043 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fndc1E9Q043 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fndc1E9Q043 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fndc1E9Q043 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fndc1E9Q043 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Fndc1E9Q043 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fndc1E9Q043 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Fndc1E9Q043 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fndc1E9Q043 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fndc1E9Q043 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fndc1E9Q043 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fndc1E9Q043 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fndc1E9Q043 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fndc1E9Q043 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Fndc1E9Q043 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Fndc1E9Q043 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Fndc1E9Q043 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Fndc1E9Q043 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Fndc1E9Q043 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Fndc1E9Q043 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Fndc1E9Q043 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Fndc1E9Q043 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Fndc1E9Q043 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fndc1E9Q043 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fndc1E9Q043 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fndc1E9Q043 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fndc1E9Q043 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fndc1E9Q043 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fndc1E9Q043 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fndc1E9Q043 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fndc1E9Q043 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fndc1E9Q043 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fndc1E9Q043 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fndc1E9Q043 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fndc1E9Q043 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fndc1E9Q043 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Fndc1E9Q043 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Fndc1E9Q043 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fndc1E9Q043 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fndc1E9Q043 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Fndc1E9Q043 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Fndc1E9Q043 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fndc1E9Q043 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fndc1E9Q043 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fndc1E9Q043 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fndc1E9Q043 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Fndc1E9Q043 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fndc1E9Q043 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Fndc1E9Q043 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fndc1E9Q043 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fndc1E9Q043 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fndc1E9Q043 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fndc1E9Q043 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fndc1E9Q043 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fndc1E9Q043 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fndc1E9Q043 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fndc1E9Q043 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fndc1E9Q043 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fndc1E9Q043 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Fndc1E9Q043 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fndc1E9Q043 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fndc1E9Q043 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fndc1E9Q043 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fndc1E9Q043 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fndc1E9Q043 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fndc1E9Q043 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fndc1E9Q043 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fndc1E9Q043 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Fndc1E9Q043 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fndc1E9Q043 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fndc1E9Q043 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fndc1E9Q043 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fndc1E9Q043 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fndc1E9Q043 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fndc1E9Q043 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fndc1E9Q043 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fndc1E9Q043 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fndc1E9Q043 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fndc1E9Q043 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fndc1E9Q043 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Fndc1E9Q043 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fndc1E9Q043 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Fndc1E9Q043 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fndc1E9Q043 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fndc1E9Q043 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fndc1E9Q043 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fndc1E9Q043 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fndc1E9Q043 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fndc1E9Q043 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fndc1E9Q043 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fndc1E9Q043 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Fndc1E9Q043 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fndc1E9Q043 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fndc1E9Q043 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms