Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ0

Ryr1, Ryanodine receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 5,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ryr1E9PZQ0 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms