Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM7

Scaf11, SR-related CTD-associated factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf11E9PZM7 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Scaf11E9PZM7 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Scaf11E9PZM7 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Scaf11E9PZM7 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Scaf11E9PZM7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Scaf11E9PZM7 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Scaf11E9PZM7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Scaf11E9PZM7 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Scaf11E9PZM7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Scaf11E9PZM7 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Scaf11E9PZM7 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Scaf11E9PZM7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Scaf11E9PZM7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Scaf11E9PZM7 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Scaf11E9PZM7 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Scaf11E9PZM7 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Scaf11E9PZM7 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Scaf11E9PZM7 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Scaf11E9PZM7 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Scaf11E9PZM7 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Scaf11E9PZM7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Scaf11E9PZM7 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Scaf11E9PZM7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Scaf11E9PZM7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Scaf11E9PZM7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Scaf11E9PZM7 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Scaf11E9PZM7 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Scaf11E9PZM7 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Scaf11E9PZM7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Scaf11E9PZM7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Scaf11E9PZM7 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Scaf11E9PZM7 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Scaf11E9PZM7 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Scaf11E9PZM7 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Scaf11E9PZM7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Scaf11E9PZM7 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Scaf11E9PZM7 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Scaf11E9PZM7 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Scaf11E9PZM7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Scaf11E9PZM7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Scaf11E9PZM7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Scaf11E9PZM7 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Scaf11E9PZM7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Scaf11E9PZM7 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Scaf11E9PZM7 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Scaf11E9PZM7 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Scaf11E9PZM7 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Scaf11E9PZM7 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Scaf11E9PZM7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scaf11E9PZM7 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scaf11E9PZM7 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Scaf11E9PZM7 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scaf11E9PZM7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scaf11E9PZM7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scaf11E9PZM7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scaf11E9PZM7 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Scaf11E9PZM7 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Scaf11E9PZM7 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scaf11E9PZM7 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scaf11E9PZM7 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scaf11E9PZM7 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scaf11E9PZM7 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scaf11E9PZM7 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Scaf11E9PZM7 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scaf11E9PZM7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scaf11E9PZM7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scaf11E9PZM7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scaf11E9PZM7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scaf11E9PZM7 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scaf11E9PZM7 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Scaf11E9PZM7 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Scaf11E9PZM7 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scaf11E9PZM7 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scaf11E9PZM7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scaf11E9PZM7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scaf11E9PZM7 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scaf11E9PZM7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scaf11E9PZM7 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scaf11E9PZM7 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scaf11E9PZM7 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scaf11E9PZM7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scaf11E9PZM7 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scaf11E9PZM7 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scaf11E9PZM7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scaf11E9PZM7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scaf11E9PZM7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Scaf11E9PZM7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Scaf11E9PZM7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Scaf11E9PZM7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Scaf11E9PZM7 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Scaf11E9PZM7 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Scaf11E9PZM7 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Scaf11E9PZM7 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Scaf11E9PZM7 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Scaf11E9PZM7 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Scaf11E9PZM7 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Scaf11E9PZM7 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Scaf11E9PZM7 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Scaf11E9PZM7 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Scaf11E9PZM7 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms