Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM4

Chd2, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd2E9PZM4 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chd2E9PZM4 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Chd2E9PZM4 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chd2E9PZM4 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chd2E9PZM4 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chd2E9PZM4 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chd2E9PZM4 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chd2E9PZM4 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chd2E9PZM4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Chd2E9PZM4 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Chd2E9PZM4 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Chd2E9PZM4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Chd2E9PZM4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Chd2E9PZM4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Chd2E9PZM4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Chd2E9PZM4 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chd2E9PZM4 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chd2E9PZM4 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chd2E9PZM4 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chd2E9PZM4 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chd2E9PZM4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Chd2E9PZM4 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chd2E9PZM4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chd2E9PZM4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chd2E9PZM4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chd2E9PZM4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chd2E9PZM4 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chd2E9PZM4 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chd2E9PZM4 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chd2E9PZM4 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chd2E9PZM4 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chd2E9PZM4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chd2E9PZM4 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chd2E9PZM4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chd2E9PZM4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chd2E9PZM4 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chd2E9PZM4 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chd2E9PZM4 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Chd2E9PZM4 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chd2E9PZM4 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chd2E9PZM4 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chd2E9PZM4 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chd2E9PZM4 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chd2E9PZM4 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chd2E9PZM4 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chd2E9PZM4 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chd2E9PZM4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chd2E9PZM4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chd2E9PZM4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Chd2E9PZM4 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chd2E9PZM4 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chd2E9PZM4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chd2E9PZM4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chd2E9PZM4 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chd2E9PZM4 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chd2E9PZM4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chd2E9PZM4 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chd2E9PZM4 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Chd2E9PZM4 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chd2E9PZM4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chd2E9PZM4 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chd2E9PZM4 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chd2E9PZM4 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chd2E9PZM4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chd2E9PZM4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chd2E9PZM4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chd2E9PZM4 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chd2E9PZM4 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chd2E9PZM4 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chd2E9PZM4 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Chd2E9PZM4 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chd2E9PZM4 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chd2E9PZM4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chd2E9PZM4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chd2E9PZM4 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chd2E9PZM4 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chd2E9PZM4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chd2E9PZM4 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Chd2E9PZM4 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Chd2E9PZM4 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Chd2E9PZM4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Chd2E9PZM4 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chd2E9PZM4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chd2E9PZM4 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chd2E9PZM4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chd2E9PZM4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chd2E9PZM4 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Chd2E9PZM4 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chd2E9PZM4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Chd2E9PZM4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chd2E9PZM4 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chd2E9PZM4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chd2E9PZM4 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chd2E9PZM4 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chd2E9PZM4 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chd2E9PZM4 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chd2E9PZM4 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chd2E9PZM4 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chd2E9PZM4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chd2E9PZM4 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms