Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gcom1E9PZ54 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gcom1E9PZ54 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gcom1E9PZ54 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Gcom1E9PZ54 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gcom1E9PZ54 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gcom1E9PZ54 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gcom1E9PZ54 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gcom1E9PZ54 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gcom1E9PZ54 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gcom1E9PZ54 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gcom1E9PZ54 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gcom1E9PZ54 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gcom1E9PZ54 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gcom1E9PZ54 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gcom1E9PZ54 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Gcom1E9PZ54 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gcom1E9PZ54 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gcom1E9PZ54 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Gcom1E9PZ54 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gcom1E9PZ54 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gcom1E9PZ54 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gcom1E9PZ54 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gcom1E9PZ54 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gcom1E9PZ54 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gcom1E9PZ54 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gcom1E9PZ54 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gcom1E9PZ54 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gcom1E9PZ54 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gcom1E9PZ54 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gcom1E9PZ54 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gcom1E9PZ54 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gcom1E9PZ54 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Gcom1E9PZ54 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gcom1E9PZ54 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gcom1E9PZ54 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gcom1E9PZ54 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gcom1E9PZ54 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gcom1E9PZ54 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gcom1E9PZ54 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Gcom1E9PZ54 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gcom1E9PZ54 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Gcom1E9PZ54 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gcom1E9PZ54 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gcom1E9PZ54 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gcom1E9PZ54 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gcom1E9PZ54 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gcom1E9PZ54 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gcom1E9PZ54 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gcom1E9PZ54 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Gcom1E9PZ54 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gcom1E9PZ54 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gcom1E9PZ54 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gcom1E9PZ54 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gcom1E9PZ54 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gcom1E9PZ54 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gcom1E9PZ54 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gcom1E9PZ54 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gcom1E9PZ54 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gcom1E9PZ54 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gcom1E9PZ54 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gcom1E9PZ54 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gcom1E9PZ54 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gcom1E9PZ54 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gcom1E9PZ54 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gcom1E9PZ54 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gcom1E9PZ54 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gcom1E9PZ54 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gcom1E9PZ54 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gcom1E9PZ54 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gcom1E9PZ54 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gcom1E9PZ54 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gcom1E9PZ54 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gcom1E9PZ54 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gcom1E9PZ54 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gcom1E9PZ54 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gcom1E9PZ54 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gcom1E9PZ54 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gcom1E9PZ54 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gcom1E9PZ54 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gcom1E9PZ54 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gcom1E9PZ54 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gcom1E9PZ54 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Gcom1E9PZ54 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gcom1E9PZ54 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms