Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Brd1E9PZ26 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Brd1E9PZ26 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms