Protein–RNA interactions for Protein: E9PYK3

Parp4, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp4E9PYK3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Parp4E9PYK3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Parp4E9PYK3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Parp4E9PYK3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Parp4E9PYK3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Parp4E9PYK3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Parp4E9PYK3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Parp4E9PYK3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Parp4E9PYK3 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Parp4E9PYK3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Parp4E9PYK3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Parp4E9PYK3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Parp4E9PYK3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Parp4E9PYK3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Parp4E9PYK3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Parp4E9PYK3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Parp4E9PYK3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Parp4E9PYK3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Parp4E9PYK3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Parp4E9PYK3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Parp4E9PYK3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Parp4E9PYK3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Parp4E9PYK3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Parp4E9PYK3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Parp4E9PYK3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Parp4E9PYK3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Parp4E9PYK3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Parp4E9PYK3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Parp4E9PYK3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Parp4E9PYK3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Parp4E9PYK3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Parp4E9PYK3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Parp4E9PYK3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Parp4E9PYK3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Parp4E9PYK3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Parp4E9PYK3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Parp4E9PYK3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Parp4E9PYK3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Parp4E9PYK3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Parp4E9PYK3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Parp4E9PYK3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Parp4E9PYK3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Parp4E9PYK3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Parp4E9PYK3 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Parp4E9PYK3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Parp4E9PYK3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Parp4E9PYK3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Parp4E9PYK3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Parp4E9PYK3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Parp4E9PYK3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Parp4E9PYK3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Parp4E9PYK3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Parp4E9PYK3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Parp4E9PYK3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Parp4E9PYK3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Parp4E9PYK3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Parp4E9PYK3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Parp4E9PYK3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Parp4E9PYK3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Parp4E9PYK3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Parp4E9PYK3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Parp4E9PYK3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Parp4E9PYK3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Parp4E9PYK3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Parp4E9PYK3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Parp4E9PYK3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Parp4E9PYK3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Parp4E9PYK3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Parp4E9PYK3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Parp4E9PYK3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Parp4E9PYK3 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Parp4E9PYK3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Parp4E9PYK3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Parp4E9PYK3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Parp4E9PYK3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Parp4E9PYK3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Parp4E9PYK3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Parp4E9PYK3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Parp4E9PYK3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Parp4E9PYK3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Parp4E9PYK3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Parp4E9PYK3 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Parp4E9PYK3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Parp4E9PYK3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Parp4E9PYK3 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Parp4E9PYK3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Parp4E9PYK3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Parp4E9PYK3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Parp4E9PYK3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Parp4E9PYK3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Parp4E9PYK3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Parp4E9PYK3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Parp4E9PYK3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Parp4E9PYK3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Parp4E9PYK3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Parp4E9PYK3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Parp4E9PYK3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Parp4E9PYK3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Parp4E9PYK3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Parp4E9PYK3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms